我国债券交易主要以银行间债券市场为主。从日常交易量来看，央票交易最为活跃，其次为政策性银行债和记账式国债，企业类债券交易清淡。从换手率指标来看，目前我国债券市场流动性最好的债券品种为短期融资券、央票和商业银行债，其换手率均在1倍以上;其次为政策性银行债，其换手率低于但很接近于1;国债的换手率水平较低，通常不到0.5倍。我国债券市场整体换手率水平为0.91倍，是美国债券市场的十分之一。

新发债从承购业务的证券公司与投资机构一经售出，便进入了债券的二级市场，债券的二级市场也称债券的流通市场。它是指对己发债券进行买卖的场所，不管是公开发行的还是非公开发行的，只要是已发债券，对此想买及想卖的债券投资者都会到这个市场上来。这个市场包括交易所交易和店头交易两个部分。证券公司或投资者那里接受了买卖委托之后，一般按以下两种方法进行处理：

其一是自己作为买卖双方的对方直接交易;

其二是自己并不直接成为买方和卖方的对方，而把该委托的证券作为代办接受下来，然后到证券交易所代为寻找适合的买主和卖主。

前者是在店头市场上进行的所谓“直接交易”，即场外交易。在这里所称的“店头”，并不是指以具体物理概念所理解的在一般证券公司背业所进行的交易，而是一种抽象的表达。店头交易实际是指证券公司中负责债券买卖的业务员与投资机构以及金融机构的有关业务员之间，通过电话联系所进行的交易。另一方面，后者指的是在证券交易所里进行的交易，称为，“委托买卖”。股票的交易绝大部分(约95%)是以“委托买卖”的形式进行的，而债券流通市场上的情形却与此相反，大多数的交易(约90%以上)都通过店头交易进行。目前在国际市场上，纽约、芝加哥、东京、伦敦等地的证券交易所中都有委托买卖的债券交易。香港、法兰克福、巴黎等地的交易所也有部分债券的交易。

债券与股票不同，有相当大的替代性。也就是说，“并非这种债券不可”，而大多数是，只要同样的利率。以及同样的偿还年月，同样的信用级别，就可以。例如，买地方债时，即便是不买广东省的债券，买上海市的债券也未尝不可，这类情况在国际市场上也很常见。另外，不买利率为8.3%的国债，将利率8.1%与8.5%的两种国债搭配购买也可以，这种替代性也是店头交易占债券交易90%以上的一条理由在店头交易中，不允许因证券公司的不同而导致买卖价格出现巨大的差异。为了加强店头市场的统一性，各国都建立了店头交易的管理机构。在国际上，还有国际债券交易员协会负责管理日常交易与结算工作。