网剧亲爱的阿基米德剧情讲述了两个天才逻辑学家言溯和天才生物学家甄爱的高智商恋爱故事。

甄爱(许龄月饰)的哥哥失踪，甄爱为寻回哥哥，按着哥哥留下来的字条，找到了居于山中养伤的言溯(吴世勋饰)。

希望他能帮自己找到消失已久的哥哥，而在之后牵扯出一系列事件的故事。在邀请言溯帮助自己寻找哥哥的同时，言溯也在无意间帮忙解决了甄爱舍友的死亡案件，而这也让言溯和甄爱愈走愈近。

久而久之，他们接触的也越来越频繁，在不断的接触中，二者发现甄爱的哥哥竟然是言溯的知己之交，并且彼此之间的联系竟然远在甄爱的少年时期就已产生。而另一方面，甄爱哥哥的消失案件变得越来越匪夷所思。