一般来说，解决夫妻两地分居的北京户口流程主要有以下几步。

首先，男方向单位提出申请，解决配偶户口。需要提供女方派遣证、转正定级表复印件，复印件加盖存档单位公章;单位所需表格，主要是备案表、登记表，以及申请人业务考核表; 结婚证书复印件;户口复印件等材料。以上收集各类材料比较耗时。收集完上述资料后，由申请人单位人事主管上报材料。等待人力资源和社会保障部的批文。接着只要等着批文下发了，批文下来后的流程就比较顺利，繁琐一些。

接下来要到北京市公安局人口管理处开动迁证明，去北京市公安局人口管理处需要带的资料：人事部批文原件;双方户口卡原件;双方身份证原件;结婚证原件; 给外地派出所的准予迁入证明;给北京落户派出所的户口迁入通知;

紧接着要办理档案调出和调入。配偶在京单位出具调档函。需要持下列资料：人事部批文原件;结婚证;北京市公安局出具的准予迁入证明;将调档函邮寄给配偶在外地的原单位人事部门。由对方开具行政关系、工资关系介绍信、档案转递单。

然后，要到外地派出所办理户口迁移证。需要提供材料如下：人事部批文原件;北京市公安局出具的准予迁入证明;配偶户口卡;配偶身份证。

最后，也是最重要的一步，落户北京，办理北京身份证。

需要提供材料如下：北京市公安局出具的准予迁入证明;从外地派出所拿到的户口迁移证;

照照片，办理新身份证。

走完这一系列的流程，就可以解决夫妻两地分居问题办理北京户口就完成了。