爱丽丝梦游仙境2：镜中奇遇记剧情讲述爱丽丝受到召唤重返仙境，为了拯救老朋友疯帽子，爱丽丝和白皇后等一起与反派“时间”展开正邪对决的故事。

爱丽丝(米娅·华希科沃斯卡饰)在过去的几年里跟随父亲去海上航行，返回伦敦后她遇到了一面神奇的镜子，穿过镜子她再一次回到了奇幻仙境，并且遇到了昔日的朋友白兔、毛毛虫、疯帽匠(约翰尼·德普饰)等，但此时疯帽匠已不是原来的他了。

爱丽丝梦游仙境2：镜中奇遇记剧照

疯帽匠病入膏肓，整个仙境都面临着被毁灭的威胁，这一切的罪魁祸首就是大反派时间(萨莎·拜伦·科恩饰)，只有打败他，才能让仙境恢复往日的繁荣。

白皇后(安妮·海瑟薇饰)帮助爱丽丝通过大时钟内部的时空传送仪回到过去，在不同的点她遇到了之前的朋友和敌人，在那里她必须与时间对抗，在时间耗尽之前拯救疯帽匠。