商朝末年，妖孽当道，民不聊生。姜子牙等揭竿而起，与闻太师率领的众妖魔交战，结果两败俱伤。云中子受元始天尊之托，为姜子牙疗伤，并将元始天尊托付的杏黄旗交予子牙，希望其遵师嘱寻找神兽。纣王得知姜子牙伤势未愈之后，真的以为西岐至此将一蹶不振，对西岐放松警惕，夜夜笙歌，整日酒池肉林，更加荒淫无度，沉迷美色，无心朝政，被妲己、申公豹所迷惑，做尽丧尽天良之事。百姓叫苦连天，天人共愤。姜子牙料知殷商气数已日渐衰尽。

西岐百姓被“四圣”兴风作浪而搞得终日人心惶惶，雷震子、哪吒、杨戬誓要前去应战，姜子牙极力阻止，生怕战事害得百姓居无定所，假意说自己重伤未愈，只为表达西岐不愿再战的决心。“四圣”得意洋洋，向闻太师禀报，闻太师将四圣正式介绍给纣王，纣王听后断定西岐已无还击之力，于是不再将西岐放在眼里。

黄飞虎边关大捷，携妻回朝歌与纣王庆功，不料纣王酒醉后因贾氏之美貌而兽性大发，做出惨绝人寰之事。为了救出贾氏，黄飞虎被纣王强制关押并施以暴行，妲己更是因为嫉妒贾氏之美貌各种使计，谋害黄飞虎之妻妹，黄飞虎与纣王自此结仇。

黄天化得知纣王对黄飞虎、贾氏的暴行后，着急前往西岐寻找姜子牙，希望子牙可以帮助自己救出黄飞虎，而纣王更是听信奸臣和妲己的谗言，要对黄飞虎用烹刑。黄天化由于找不到姜子牙犯愁，姬发和杨戬得知纣王惨无人道的暴行后，自知不能袖手旁观，决定代替子牙帮助黄天化与暴君纣王对抗，救出黄飞虎。杨戬利用自己的三眼之力击退众敌，成功救出黄飞虎。纣王得知勃然大怒，派人追拿黄飞虎。杨戬使用调虎离山之计，成功转移黄飞虎，纣王盛怒，派兵出征西岐，并指派国师申公豹监战，誓要灭了西岐。西岐百姓，可谓危在旦夕。

九龙岛“四圣”被纣王、申公豹蛊惑，大肆宣战，搞得西岐昏天暗地，旨在毁掉西岐，百姓叫苦连天，怨声载道。姜子牙决定亲自领兵出战，命杨戬、雷震子、哪吒、土行孙分别擒住“四圣”，并阐明不希望相互厮杀，愿“四圣”能够多为天下百姓考虑，多做仁义之事，最后甚至放归“四圣”回九龙岛。“四圣”被姜子牙的言行所感动，悔悟自己受谗言之蛊惑，没有及时分清善恶美丑，并自省战乱给百姓带来的伤害，对姜子牙表示歉意后决意退战。申公豹半路拦截，见“四圣”去意已决，兽性大发，用毒酒取“四圣”性命，嫁祸西岐，甚至妄图挑拨截教与阐教，诬陷西岐杀害九龙岛“四圣”。天君知此气愤异常，决心以矩阵对付西岐。闻太师回到朝歌后，得知四圣死讯，加上申公豹煽风点火，誓与西岐势不两立。由于申公豹、妲己等众妖的挑拨，众神与西岐的误会越来越深。一场大战在所难免。

西周势力早已日渐强大，周文王驾崩，其子姬发继位，成为周武王。武王拜姜子牙为相父，子牙正式辅佐武王，起兵讨伐商纣。姜子牙亲自率领的周军攻破了殷商的各个关卡，最后兵临城下。纣王无奈欲与姬发议和，想到纣王的暴行、百姓的民不聊生、怨声载道，姬发果断拒绝纣王的提议。闻太师虽一生忠于纣王，也深知成汤天下必亡，自己也已无力挽救，自尽绝龙岭。

朝歌城外，一场永驻史册的牧野之战拉开战幕。申公豹和妲己有意挑拨，让通天教主大摆诛仙阵，令西岐众将死伤无数，金吒、木吒皆奉师命下山破解诛仙阵，纣王最终兵败，深知殷商之大势已去，在摘星楼下自焚身亡，周王朝自此成立。封神台上，姜子牙封诸神。

至此天下太平，正义战胜邪恶，百姓向往之和谐大同世界初显，一派祥和。

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